(一)香赞
戒定真香焚起冲天上弟子虔诚热在金炉上顷刻纷纭即遍满十方昔日耶输免难消灾障
南无香云盖菩萨摩诃萨(三称)
(二)称圣号
南无药师会上佛菩萨(三称)
(三)药师灌顶咒(二十一遍)(或大忏悔文一遍)
南无薄伽伐帝·鞞杀社·窶噜·薜·琉璃·钵喇婆·喝啰阇也·怛他揭·多耶·阿啰诃谛·三藐三勃陀耶怛·姪他·唵·鞞杀逝·鞞杀逝·鞞杀社·三没揭谛·莎诃
(四)唱赞偈
药师佛延寿王，光临水月坛场，悲心救苦降吉祥，免难消灾障，忏悔众等三世罪，愿祈福寿绵长，吉星高照沐恩光，如意保安康。吉星高照沐恩光，如意保安康。药师如来琉璃光，焰网庄严无等伦，无边行愿利有情，各遂所求皆不退。
南无东方净琉璃世界消灾延寿药师佛
南无消灾延寿药师佛(约数百声)
(五)拜愿
南无本师释迦牟尼佛(三拜)
南无消灾延寿药师佛(十二拜)
南无日光遍照菩萨(三拜)
南无月光遍照菩萨(三拜)
南无药师海会佛菩萨(三拜)
(六)三皈依
自皈依佛·当愿众生·体解大道·发无上心;
自皈依僧·当愿众生·统理大众·一切无碍。和南圣众。
一.药师佛简介
亦称药师如来、药师琉璃光如来、大医王佛、医王善逝、十二愿。
二、功德介绍
药师，为东方净琉璃世界之教主。此佛于过去世行菩萨道时，曾发十二大愿，愿为众生解除疾苦，使具足诸根，导入解脱，故依此愿而成佛，住净琉璃世界，其国土庄严如极乐国。
如《药师琉璃光如来本愿功德经》云，“若有净信善男子善女人等，乃至尽形不事余天，惟当一心归佛、法、僧，受持禁戒，若五戒、十戒、菩萨四百戒、苾刍二百五十戒、苾刍尼五百戒，于所受中或有毁犯，怖堕恶趣，若能专念彼佛名号恭敬供养者，必定不受三恶趣生。或有女人，临当产时，受于极苦，若能至心称名礼赞，恭敬供养彼如来者，众苦皆除。所生之子，身分具足，形色端正，见者欢喜，利根聪明，安隐少病，无有非人，夺其精气。”
“若有四众，苾刍、苾刍尼、邬波索迦、邬波斯迦，及余净信善男子、善女人等，有能受持八分斋戒，或经一年，或复三月，受持学处，以此善根，愿生西方极乐世界无量寿佛所，听闻正法，而未定者。若闻世尊药师琉璃光如来名号，临命终时，有八大菩萨，其名曰文殊师利菩萨，观世音菩萨，得大势菩萨，无尽意菩萨，宝檀华菩萨，药王菩萨，药上菩萨，弥勒菩萨，是八大菩萨，乘空而来，示其道路，即于彼界种种杂色众宝华中，自然化生。或有因此生于天上，虽生天上，而本善根亦未穷尽，不复更生诸余恶趣。天上寿尽，还生人间，或为轮王，统摄四洲，威德自在，安立无量百千有情于十善道;或生刹帝利、婆罗门、居士大家，多饶财宝，仓库盈溢，形相端正，眷属具足，聪明智慧，勇健威猛，如大力士。若是女人，得闻世尊药师琉璃光如来名号，至心受持，于后不复更受女身。”
“若复有人，忽得恶梦，见诸恶相，或怪鸟来集，或于住处，百怪出现，此人若以众妙资具，恭敬供养彼世尊药师琉璃光如来者，恶梦恶相，诸不吉祥，皆悉隐没，不能为患。或有水火刀毒、悬险恶象、师子虎狼、熊罴毒蛇、恶蝎蜈蚣、蚰蜒蚊虻等怖;若能至心忆念彼佛，恭敬供养，一切怖畏，皆得解脱。若他国侵扰，盗贼反乱;忆念恭敬彼如来者，亦皆解脱。”
此佛誓愿不可思议，若有人身患重病，死衰相现，眷属于此人临命终时昼夜尽心供养礼拜药师佛，读诵《药师如来本愿功德经》四十九遍，燃四十九灯，造四十九天之五色彩幡，其人得以苏生续命。
如果能够不断读诵药师经典，思惟其义，则善愿能得药师佛加持得以圆满。如《药师琉璃光如来本愿功德经》云，“随所乐求，一切皆遂，求长寿得长寿，求富饶得富饶，求官位得官位，求男女得男女。”
弘一大师云，“余自信佛法以来，专宗弥陀净土法门，但亦当讲《药师琉璃光如来本愿功德经》，讲此经时所最注意者三事：一、若犯戒者，闻药师名号已还得清净。二、若求生西方极乐世界，而未定者，得闻药师名号，有八大菩萨示其道路，即生极乐世界众宝华中。三、现生种种厄难悉得消除。”
歌曲：礼拜药师佛
三、赞颂(语)
药师如来琉璃光，焰网庄严无伦比
无边行愿利有情，我今所求皆如意。
四、礼敬(身)
思惟药师佛无量功德事业，内心发欢喜，而虔诚顶礼三、七或二十一、百八遍，或右绕三匝、七匝、百匝。五、祝愿方式
心中默想自己现前当来之如法善愿而念“南无消灾延寿药师佛”(三遍)，然后口念自己之愿，希望药师佛加被自己善愿能满(例如愿消灾延寿、产妇平安、解冤释结、身体健康、亲友健康等等)。
所谓有求必应、心诚则灵，祝愿成功之关键在于：(一)、虔诚恭敬，相信三宝有力量成办自己之心愿，持续地祈求;(二)、所求应是不损害他人利益之事，也就是要明白佛菩萨是善愿满足、恶愿不会满足的;(三)、身体健康之因，须结束杀业、多放生命、施众生欢喜无畏等;(四)、不论此尊之像做工庄严、细致与否，皆不应说此像不好、不美、甚难看等等;不论此尊之像以铜、金、木、石、泥乃至巴掌大的一张纸或商标形式出现，皆应心存恭敬，皆能得福。六、介绍药师佛功德事迹的经文有：
《药师琉璃光如来本愿功德经》、《药师七佛本愿功德经》等。