闭关，又称掩关，这个名词和风气在印度没有，中国也是到元朝之后，甚至到了明朝，才看到这种修行方式的记载。闭关可能渊源于西藏佛教的长期洞窟修炼，当喇嘛随着蒙古王朝到了中国内地，闭关方式也日渐风行。《禅林象器笺》中说：“自入元，始有闭关之说。……自入明，乃有闭关学道之事。”
在佛教的修行方法中，有定时的、定期的功课以及一定时段的修法，比如七天、二十天、四十九天、九十天、一百天等，克期取证，专心修持某一法门，如果环境许可，确实需要，也可为期一年、三年，乃至六年、九年、数十年。但并不一定是单独地个人修持。例如：释迦时代的结夏安居，中国禅林的冬、夏两季禅期，是集合许多人共同修行的。天台宗祖师们编撰的忏法、仪轨，都是集合六、七人或数十人共同结坛而修的。在佛世时的结夏安居，也是在一定的范围之内，或于树下，或于洞窟，或于自建的茅舍，或于居士家的空舍，是个别修行的。但那些都不是现在所说的闭关。
古代禅宗中流行一句话：“不破参，不住山；不开悟，不闭关。”可见对禅僧来说，必须等开悟后，才能有资格闭关。因为闭关修行需要一定基础，否则，闭上三、五年，不是一无所成，便是因为魔障，不能如期地完成原来的誓愿。除禅宗之外，其他各宗派的研修者也常有闭关之举。如净土宗为了念佛修行，闭净土关；华严宗为了修法界观，读诵《华严经》，闭华严关。在佛教中，有一种名为“闭生死关”最为感人，有些大修行人发大誓愿，愿于一生中了脱生死，所以令自己人生的最后几年或十多年在闭关生活中度过，直到自己觉得有了生死的把握才出关；如果没有把握，便誓不出关。
现在的丛林大寺院中，仍有一些修行僧在闭关修行，一般闭关的人有两种目的：一者，为了能集中精力阅读大藏经；二者，能够顺利专修某一法门。所以，期限各不相同，有些数月，也有数年的。闭关者住的房子称为“关房”，一般都建在僻静处，关房必须具备一定的生活条件，如有小阳台能让闭关者晒到太阳，内有厕所等等。在闭关期间，以不出关房为原则。所以在关房外，必须有人护持饮食、医药等事，称为“护关”。
在寺院中，有人愿意闭关修行，是一件很重大的事情，所以要举行很隆重的闭关仪式。寺院的僧人集中在大殿，维那师举香赞，接着念“南无大悲观世音菩萨”三称，《大悲咒》三遍，《心经》一遍，“摩诃般若波罗蜜多”三称，唱观音赞“菩萨号圆通”，关主（闭关的人）行十方礼，感谢大众成就他的修行，祈求佛菩萨加持。接着，唱“观音菩萨妙难酬”八句偈，大众念观世音菩萨圣号，每人拿一枝香，送“关主”到关房前。在关房前预设香桌，方丈和尚、关主拈香，接着敲引磬三阵，方丈说法，说明闭关的重要意义，劝关主能珍惜这殊胜的因缘，在关中努力修行。说法后，和尚说“请”，关主进门时，回首礼谢大众，三拜关门，大众回大殿念回向偈。
关主闭关结束时，寺院也举行很隆重的仪式来祝贺，并且有很多信徒来供养关主。首先由客堂挂“启关牌”通知大众，大众在听到午梆后齐集大殿，唱香赞，念“南无本师释迦牟尼佛”三称，接着念“天上天下无如佛”四句偈。大众念“南无本师释迦牟尼佛”圣号到关房前，悦众敲引磬三阵，方丈和尚说法，说毕，和尚用“如意”一击关锁，喊“开”，关主出关后，随方丈到大殿念回向谒，再拈香上供。上完供后，关主必须在大殿中礼谢大众。
闭关修行能够放下杂务，杜绝外缘，是专事修行的最佳方式之一。但是，必须具备许多因缘条件，一者闭关者的禅定功夫，二者有寺院能成就，所以非常不容易。