“万法皆空，因果不空”，“万法皆空”讲的是空性，“因果不空”讲的是缘起。不是除了“万法”以外还有一个“因果”，此二者是一个意思。万法的本性是空的，因果的作用是不会空的。因果的作用就是缘起，缘起是不会空的。缘法就是因果，因果就是缘法，只是用词不一样。
佛讲的“空性”不是“没有”。虽然“空”是“没有”的意思，但这个“空”与“有”是一体的，是双运的。《心经》讲：“色不异空，空不异色。色即是空，空即是色。”“色即是空”讲的是性空，“空即是色”讲的是缘起，“色即是空、空即是色”它们两个是一体的;“色不异空”就是缘起不离性空，“空不异色”就是空性不离缘起，既是缘起又是性空，二谛双运。这就是诸法的事实真相。
我们凡夫平常讲的“色”就是有，“空”就是没有，认为有和没有是相反的，无法了知“有”和“没有”是双运、一体的这种事实真相。
一切法的真相和真理，是“有”和“没有”双运、一体的。双运的“有”和“没有”，已经超越了我们的思想范围。站在凡夫的境界里，不能说“有和没有是一体的”;站在佛的境界里，可以说是一体的。诸法是“空”的，但是缘起的作用“不空”，这个“空”与“不空”是一个意思。“空”不是如虚空似的，什么也不存在。“不空”也不是真有、实有的有。
因果是在缘起上、在相上，相上有;空是在体上，体上没有。“有”和“没有”是一体的。因果报应是在相上，在缘起上讲的，不是在体上讲的。造恶业要感受痛苦，修善法能得到善果，这是缘起法。在胜义谛上、在体上讲，好坏、善恶都是无自性的，都不是实有、真有的。但在缘起上、在显现上讲，好坏、善恶还是有，对我们来说不是虚假的。所以不能认为是空，就不取舍因果，不去修行。明白空性这个道理以后，取舍因果要更加严格、仔细。
因果规则本身也是空性，因为是空性才有因果;因为是因缘果报，所以都是空性。它们两个是相辅相成的。因果是不空的，缘起是不空的，但这个“不空”，也不是真有、实有。这是最高的一种见解，也是诸法的事实真相。所以如果你只修空性，不取舍因果，也不是正道，也是修偏了。
旧译宁玛派开山祖师莲花生大士曾经对国王赤松德赞说：“君王，我的密乘见解极其重要，但是行为不能偏堕于见解方面，否则善空恶空黑法漫布，将成为魔见。同样，见解也不能偏堕于行为方面，否则将被实有和有相所束缚而无有解脱的机会。” 行为不能跟着见解走，若是行为跟着见解走，那就是善空恶空，叫做黑法漫布，成为恶魔的见解。用“黑”这个词来形容是因为对空性有偏见是最大、最严重的邪见;同样，见解也不能跟着行为走，见解是“空”的，但行为“不空”。见解是性空，行为是缘起。如果我们把缘起法都视为实有、真有，见解如果跟着行为走，那这些现象就会束缚你，你就无法解脱。所以莲花生大士又说：“是故见比虚空高，取舍因果较粉细。”“虽然我的‘见’可以像天空那么广阔，但我的‘行’和我对因果的尊敬却必须像面粉粒那么细密。”意思是说空性的见解再高，取舍因果要比面粉还细。
“万法皆空，因果不空”，万万不可以高深见解的法语来轻视因果。现在用无我和空性等高深见解来轻视因果的情况非常严重。很多人对佛所讲的空性都理解错了，修禅宗、密宗都修偏了，认为万法都是空的、虚假的，那就没有善恶，也不用取舍善恶、取舍因果。然后随便杀生、吃肉、喝酒、邪淫，轻视戒律，诽谤因果。
阿底峡尊者曾经讲：“自从我本人进入别解脱门之后，可以说是一尘不染;对于菩萨学处(菩萨戒)，偶尔出现过一两次过失;而步入密宗金刚乘以后，虽然零零碎碎的过失屡有出现，但都是当下忏悔，从来没有让堕罪过夜的情况。”尊者在行途中也是一样，每当闪现恶分别念时，马上取出一个木制的曼茶罗，立即忏前戒后。因此学密法，就更应该严明，戒律更多。
旧译宁玛派祖师麦彭仁波切在《定解宝灯论》中讲：“正修盲修之差别，断证增进而了知。”你所修的法是不是正法，禅定是不是如法，就看你的内心烦恼是不是减少了、觉性智慧是不是高了。智慧越来越高，烦恼越来越少，那就是对的。很多人修行，功德越来越少，智慧越来越少，邪知邪见越来越多了，烦恼越来越多了，这样修的就不是正法。
帕单巴仁波切是印度的一位大成就者(有一种传说，说他是汉地禅宗的达摩祖师，他离开汉地后来到了藏地)。藏民第一次见到他的时候，他是个长胡子的老人，在藏地住了很长时间，活了五六百岁。有人问帕单巴仁波切：“如果证悟了空性而造罪，到底是有害还是无害呢?”帕单巴仁波切回答说：“如果真正彻悟了空性，就绝不会造罪，因为证悟空性和生起悲心是同时的。”真正证悟了空性、生起了大悲心，绝对不会造恶业伤害众生。如果你还在造恶业，说明你肯定没有证悟空性。龙树菩萨说：“诸法了知皆空性，仍然不离业和果，稀有又此极稀有，稀奇又此极稀奇。”善有善报，恶有恶报;种瓜得瓜，种豆得豆。这些道理是任何时候都不会改变的法则，是诸法的事实真相，是宇宙人生的一种规律。
那种不取舍因果，以单空为究竟法的观点，都是偏见、邪见。如果持这种邪见就等于断绝了自己积累智慧资粮、福德资粮这两种成佛资粮的机缘。这两种资粮是获得法身和色身的因。怙主龙树菩萨亲口说：“此善愿诸众，圆满福慧资，获得福慧生，殊胜之二身。”佛有法身佛与色身佛，因也有两个：福德资粮、智慧资粮。智慧资粮做为因，福德资粮做为缘，会产生法身佛;福德资粮做为因，智慧资粮做为缘，会产生色身佛。诸法是空的，但是要成就二身佛，也要积累两种资粮。
所以应该明了“空”与“有”是一体的，是双运，不是单空，也不是单有。应该是二谛双运，世俗谛和胜义谛双运双修，不能分开。不能单独去抓空性，也不能单独去抓缘起。如果单独这样抓，是不会有成就的。