嘛呢是梵文佛经《六字真言经》的简称，玛尼石堆则是由刻有六字真言的玛尼石堆砌而成。“玛尼石”名称的由来，是取六字真言中第二、第三两字而来。藏传佛教把这六字真言看作了佛教经典的根源。即“六字大明”，“唵嘛呢叭咪吽”，此明咒之殊胜，非薄福之人所能值遇。如《佛说大乘庄严宝王经》中，佛对除盖障菩萨说，当时佛为求得六字真言，于无量世间供养千万俱胝如来，尚未求得，后因承事供养胜莲如来方才得到，而胜莲如来亦由承事供养无量如来方得此法。
书写六字大明咒一字所获果报功德不可思议。《佛说大乘庄严宝王经》云：“若有人书写此六字大明陀罗尼者。则同书写八万四千法藏而无有异。若有人以天金宝。造作如微尘数如来应正等觉形像。如是作已。而于一日庆赞供养。所获果报不如书写此六字大明陀罗尼中一字所获果报功德。不可思议善住解脱。”本来建造佛像的功德已是大的不可思议，但经中云书写此六字大明陀罗尼中一字所获果报功德超过造如微尘般众多的佛像，这真是个不可思议的法门啊！
据说，早在公元641年，文成公主进藏，在玉树地区就有了汉、藏、梵三种文字的石刻。这些六字真言最早的石刻，距今已有两千多年历史。
玛尼堆也称“十万经石”堆，是人为的神圣所在。人们周而复始地围绕它旋转，成为民间简易的礼佛朝拜场所。大量堆置在选定的特殊地点，比如说来往行人多的道路边或者是风水上有缺陷的地方，经加持开光后，不但可以促进地方的和平，同时也可以加持一切过往的众生，令他们皆能获得佛法的利益。
玛尼石易保存长久坚固的特质
华智仁波切为玛尼堆专门写下以下文字：“建造此等能依，能利益无边众生，但土堆与泥像容易被水侵坏，金银铸成的有被盗之险，壁画与唐卡也难挡违缘，若建造经堂，责难以找寻如法供养和管理者，语能依经典书函也易散难持，而只要玛尼石堆建造以后，夏日无需修顶防漏，冬日不用扫雪御寒，也不必提防鸟巢鼠害，更不要管家像灯师。所以，别人的能依建造如同只抓树枝，而我乃如同抓住树根看到了重点，即便是恶敌强盗漫山遍野，也无需担心被人偷盗而可长存于很多世代。”
玛尼石长久持续的加持力
参与捐资刻玛尼者，将获得所有捐刻玛尼石的功德，同时还获得所有转绕玛尼石堆者的转绕功德；玛尼石能够保存的非常长久，千年也不会腐烂，即使石头腐烂了，玛尼功德也不会消失。凡参与捐刻玛尼石者，在石头未损坏前，以后无论转生到那一道(天、人、阿修罗、畜生、饿鬼、地狱)都将持续的获得加持。
玛尼石见闻忆触的利益
风吹到玛尼石上再接触到的众生，都将因玛尼石而受益。病中之人，清静心瞻仰、供奉、转绕石经，将逐渐痊愈。善缘发心增刻者，将种下广大善因，现世平安健康吉祥，增上福报，功德累世不失。
玛尼石与忏悔、发愿
一般的忏悔和发愿类的玛尼石是以文字为主，图像为辅。忏悔类玛尼石产生的背景往往是由于人们在耕作或游戏时不慎踩死一只虫、蛙之类的小生物，虽属无意，但是毕竟是伤害了一个生命，所以就在某个良辰吉日，虔心祷颂后刻一块有青蛙草蛇之类形象的玛尼石。石头的正面基本上是一句或连续不断的六字箴言，石头背面往往刻一行“为打死蛇赎罪，向成事佛致敬”的款识。
发愿类的玛尼石在许多地区都很常见。这类玛尼石一般是由小狗小羊和一片咒文组合而成，通常是属狗或属羊的人的行为曾经有违背佛教教义之举，甚至做了违法的勾当，旁人并不知道。但是因自知、天知、地知、佛知而寝食难安，所以往往需要去较远的地方请朵多镌刻一块甚至数块有个人标志（如属相）的玛尼石去供奉，用以向佛祖发誓：金盆洗手，下不为例。甚至还有烟鬼酒徒为了戒除嗜好，也会如此炮制，表示自己的决心。
如是种种，不胜枚举，总之愿以我们每个人滴点的善根如水溶于水，虚空融入虚空般，融入到阿秋喇嘛和马智多洛尊者广大无边的愿海功德中。