临床经验证实，常吃黑木耳对各种异物造成的胃肠不适和体内结石的特殊辅助疗效。
黑木耳对无意食下的难以消化的头发、谷壳、木渣、沙子、金属屑等异物具有溶解与烊化作用。为防止和治疗各种异物造成的胃肠不适或病症，不妨常吃些黑木耳，尤其是从事理发、开矿、粉尘、锯木、修理、护路等作业的人员更应经常食用。
黑木耳对胆结石、肾结石、膀胱结石、粪石等内源性异物也有比较显著的化解功能。
黑木耳之所以具有这些神奇的功能，一方面是因为它所含的发酵素和植物碱，具有促进消化道与泌尿道各种腺体分泌的特性，并协同这些分泌物催化结石，滑润管道，使结石排出。另一方面则是黑木耳还含有多种矿物质，能对各种结石产生强烈的化学反应，剥脱、分化、侵蚀结石，使结石缩小，排出。
食用黑木耳化解结石的方法是，对于初发结石，保持每天吃适量的黑木耳，疼痛、恶呕等症状可在2-4天内缓解，结石能在10天左右消失。对于较大较坚固的结石，其效果相对要差一些，但如经常食用黑木耳，亦可使有些人的结石逐渐变小变碎，排出体外。
需要强调的是，黑木耳溶解异物和化解结石只能起到预防和辅助作用。如果异物太大、太多或结石大而坚固给患者带来了痛苦，就一定要及时就医，以免耽误病情。
此外，常吃黑木耳，还能预防血栓等症的发生。