普洱茶虽然有极多的功效，但也是有一定的副作用的，主要是针对女性朋友在特殊的时期及不同的体质，而且在生理期来临时，经血会消耗掉不少体内的铁质，但若此时在饭饱之际喝茶的话，茶叶中高达50%的鞣酸会妨碍我们的肠粘膜对铁质的吸收，大大减低铁质的吸收程度，因而在肠道中，食糜中的铁质或补血药中的铁很容易结石产生沉淀的现象。
而且孕妇正值怀孕期也不适合喝普洱茶。一般浓茶中咖啡碱的浓度高达10%，会增加孕妇的尿量，增加心跳次数，加重孕妇的心脏和肾脏的负荷，更可能会导致妊娠中毒症，因此最好少喝茶为妙。临产期时也不宜喝普洱茶。因产前若喝太多茶的话，茶中的咖啡碱会产生兴奋作用而产生失眠，倘若孕妇在产前睡眠不够，那可能会导致分娩的时候精疲力竭，甚至还会造成难产的情况出现。
此外，生产后想亲自哺乳的产妇也不宜喝普洱茶。因为这期间要是喝下大量的茶，茶中含有的高浓度鞣酸会被粘膜吸收，进而影响乳腺的血液循环抑制乳汁的分泌，造成奶水分泌不足。茶中的咖啡碱可渗入乳汁并间接影响婴儿，对婴儿的身体健康不利。