大黄性味苦寒，久服易损伤脾胃，过量服用可引起恶心、呕吐、头昏、腹胀、腹痛、腹泻等症状。大黄虽是通便良药，但还是会引起继发性便秘，这是由于大黄含有通大便成分，同时还含有止泻成分，其小剂量服用后有时不仅不引起泻下反应，且呈收敛作用，停药后即出现继发性便秘。可一旦发生继发性便秘，只要增食膳食纤维或多饮水、多按摩腹部、增加运动量及调整心理状态，建立正常排便反射，便可消除。
而且长期依赖大黄的泻下作用来排毒，还会影响人体对某些有益物质的吸收，造成贫血的不良后果。而且大黄中还含大量草酸，长期服用可能引发肾、膀胱结石等副作用。但是只要按医生的要求合理服用大黄，还是不会存在副作用的。长期的用药历史和广泛的使用证明，大黄是是一味出将入相的良药，不论男女，不论是花甲老人还是幼童，都能使用。