毗卢遮那佛左右两边，有文殊和普贤两位菩萨。毗卢遮那佛代表自性，代表最究竟的菩提果位。为什么两位菩萨能成为毗卢遮那佛的左膀右臂呢？这就是让我们了知要回归自性，要证得究竟的佛果，必须要靠两位菩萨所代表的智慧和愿行。
文殊菩萨的智就像双眼，普贤菩萨的行就像双脚。要到达彼岸，要圆满菩提果，不能离开文殊菩萨的智慧，也不能离开普贤菩萨的行愿。行愿谁都有，但是有智慧是很重要的。有智慧，行愿才会圆满。阿罗汉、独觉佛也有愿行，但是他们的愿行不究竟、不圆满，因为缺少智慧。若是具足智慧，他们也不可能求自我解脱。
世间人希求世间的福报也叫愿。为了世间的福报，人天的安乐，他们也行持善法，积累福德，这也是行，但是这些更不究竟。即使愿行圆满了，获得了人天的福报与安乐，也没有用，还是没有逃脱三界，没有摆脱痛苦。名气再大，再有钱，还是一样烦恼痛苦。也许内心的烦恼痛苦更大了。这就是缺乏智慧。若是具足智慧，他们也不会为了获得人天的安乐去行持善法。智慧很重要，所以要有文殊菩萨的智慧。
文殊菩萨是诸佛智慧的象征与显相，也可以说是诸佛圆满智慧的显现。文殊菩萨形象上是菩萨，实际上他就是究竟的智慧，就是觉性圆满的象征。除此，没有再究竟的智慧，没有再圆满的智慧。有究竟、圆满的智慧做向导，不会走偏，愿行一定会达到最究竟、最圆满。
二位菩萨代表福德和智慧，也可以说代表方便和智慧。有文殊菩萨的智慧，才会有普贤菩萨的行愿；有普贤菩萨的行愿，一定会有文殊菩萨的智慧，这两者是相辅相成的。要福慧双修，方便和智慧双运才能回归自性，才能获得圆满。